Gbif.es » Formación y divulgación » II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank
Taller
Tipo

Presencial

Fecha comienzo Taller

13/06/2023

Fecha fin Taller

14/06/2023

Lugar

Aula de informática del CSIC

Dirección

c/ Joaquín Costa, 22.

Cómo llegar

Link Google Maps

A cargo de

Yolanda Jiménez Ruiz, Brent Emerson, David García San León, Francisco Pando, Gloria Martínez

Idioma

Castellano

Máximo nº de participantes

20

Horas estimadas de dedicación

10

II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank

Descripción: El avance de los estudios de biodiversidad de la mano de las técnicas moleculares y nuevos enfoques ecológicos en tiempos recientes ha sido espectacular. Sin embargo, la falta de procedimientos y prácticas para hacer las conclusiones de estos estudios revisables pone en cuestión su solidez y validez científica en muchos casos. En este contexto, la importancia de los ejemplares de colecciones como pilar del método científico en estos estudios es cada vez más reconocida y aceptada. Esta situación es una oportunidad para las colecciones, si al publicar sus datos en línea se hace con enlaces al  GenBank y si se colabora con los repositorios de GenBank para que desde estos se enlace a los ejemplares de respaldo. Cómo hacerlo es el objeto de este taller. Pasos a seguir para matricularse: Rellenar el formulario de inscripción hasta el 9 de mayo de 2023. La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 22 de mayo de 2023*. Publicación de la lista de alumnos en la página web del taller el 29 de mayo de 2023. *Si no se ha recibido confirmación en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente. Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos: Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF. Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución. Conocimientos sobre la materia. Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática. Orden de inscripción.

Programa

Martes 13 de junio de 2023

09:30 - 10:00

  • Bienvenida e introducción al curso
  • GBIF y la información primaria sobre biodiversidad

10:00 - 11:00

  • Qué es el GenBank

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:30

  • El papel de las colecciones de historia natural en los estudios moleculares - Yolanda Jiménez Ruiz
  • La iniciativa "Barcode of Life" y las colecciones - Brent Emerson

13:30 - 15:00 Pausa comida

15:00 - 17:00 (30' para café)

  • Implicaciones para las colecciones. Muestreos destructivos
    • Principios generales y colecciones botánicas
    • Aspectos específicos de las colecciones zoológicas
  • Experiencias previas
  • Debate: el tema de los materiales testigo, su citación: buenas y malas prácticas

Miércoles 14 de junio de 2023

9:30 - 11:00

  • Las bases de datos del GenBank (presentación estructura, información que contiene, identificadores)
  • Cómo tratar la información molecular en las colecciones de HN y sus implicaciones en los procedimientos de trabajo y sus bases de datos

11:00 - 11:30  Pausa café

11:30 - 13:00

  • Cómo colaborar con GenBank para enlazar la información de las secuencias con las bases de datos en línea de las colecciones

13:00 - 13:30 Discusión final, evaluación y cierre del taller

 

- evento realizado, materiales disponibles -

tallerBasesDatosColeccionesGenBank2023

Ver más en twitter

Listado de Participantes

Nombre Organización
1 Casas Castaño Laura Instituto de Investigaciones Marinas (IIM-CSIC)
2 Muñoz Colmenares Manuel Eduardo Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva
3 García González Francisco José TRAGSATEC
4 Paredero García Manuel César IRNASA - CSIC
5 Rodríguez Fernández Sergio Universidad de León
6 López Llorens Javier Escuela Técnica Superior de Ingeniería de Montes, Forestal y del Medio Natural (ETSMFMN) (UPM)
7 Alté García-Olías Luis Real Jardín Botánico - CSIC
8 Sánchez Vialas Alberto MNCN - CSIC
9 Buira Clua Antoni Real Jardín Botánico - CSIC
10 de la Cruz Calleja Ana Carmen INIA - CSIC
11 Calvo Revuelta Marta MNCN - CSIC
12 Alfaro Saiz Estrella Herbario LEB. UNILEON
13 Cabrero Sañudo Francisco José Museo de Entomología UCME - Universidad Complutense de Madrid
14 Muñoz de los Reyes Isabel Centro Oceanográfico de Cádiz, IEO - CSIC
15 Pascual Alayón Pedro José Instituto Español de Oceanografía