II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank
Descripción:
El avance de los estudios de biodiversidad de la mano de las técnicas moleculares y nuevos enfoques ecológicos en tiempos recientes ha sido espectacular. Sin embargo, la falta de procedimientos y prácticas para hacer las conclusiones de estos estudios revisables pone en cuestión su solidez y validez científica en muchos casos. En este contexto, la importancia de los ejemplares de colecciones como pilar del método científico en estos estudios es cada vez más reconocida y aceptada. Esta situación es una oportunidad para las colecciones, si al publicar sus datos en línea se hace con enlaces al GenBank y si se colabora con los repositorios de GenBank para que desde estos se enlace a los ejemplares de respaldo. Cómo hacerlo es el objeto de este taller.
Pasos a seguir para matricularse:
Rellenar el formulario de inscripción hasta el 9 de mayo de 2023.
La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 22 de mayo de 2023*.
Publicación de la lista de alumnos en la página web del taller el 29 de mayo de 2023.
*Si no se ha recibido confirmación en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
Conocimientos sobre la materia.
Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
Orden de inscripción.
Programa
Martes 13 de junio de 2023
09:30 - 10:00
- Bienvenida e introducción al curso
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad
10:00 - 11:00
- Qué es el GenBank
11:00 - 11:30 Pausa café
11:30 - 13:30
- El papel de las colecciones de historia natural en los estudios moleculares - Yolanda Jiménez Ruiz
- La iniciativa "Barcode of Life" y las colecciones - Brent Emerson
13:30 - 15:00 Pausa comida
15:00 - 17:00 (30' para café)
- Implicaciones para las colecciones. Muestreos destructivos
- Principios generales y colecciones botánicas
- Aspectos específicos de las colecciones zoológicas
- Experiencias previas
- Debate: el tema de los materiales testigo, su citación: buenas y malas prácticas
Miércoles 14 de junio de 2023
9:30 - 11:00
- Las bases de datos del GenBank (presentación estructura, información que contiene, identificadores)
- Cómo tratar la información molecular en las colecciones de HN y sus implicaciones en los procedimientos de trabajo y sus bases de datos
11:00 - 11:30 Pausa café
11:30 - 13:00
- Cómo colaborar con GenBank para enlazar la información de las secuencias con las bases de datos en línea de las colecciones
13:00 - 13:30 Discusión final, evaluación y cierre del taller
- evento realizado, materiales disponibles -
tallerBasesDatosColeccionesGenBank2023
Ver más en twitterDocumentos de Interés
Materiales del II Taller GBIF.ES: Bases de datos de colecciones y GenBank
Listado de Participantes
| Nº | Nombre | Organización |
|---|---|---|
| 1 | Casas Castaño Laura | Instituto de Investigaciones Marinas (IIM-CSIC) |
| 2 | Muñoz Colmenares Manuel Eduardo | Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva |
| 3 | García González Francisco José | TRAGSATEC |
| 4 | Paredero García Manuel César | IRNASA - CSIC |
| 5 | Rodríguez Fernández Sergio | Universidad de León |
| 6 | López Llorens Javier | Escuela Técnica Superior de Ingeniería de Montes, Forestal y del Medio Natural (ETSMFMN) (UPM) |
| 7 | Alté García-Olías Luis | Real Jardín Botánico - CSIC |
| 8 | Sánchez Vialas Alberto | MNCN - CSIC |
| 9 | Buira Clua Antoni | Real Jardín Botánico - CSIC |
| 10 | de la Cruz Calleja Ana Carmen | INIA - CSIC |
| 11 | Calvo Revuelta Marta | MNCN - CSIC |
| 12 | Alfaro Saiz Estrella | Herbario LEB. UNILEON |
| 13 | Cabrero Sañudo Francisco José | Museo de Entomología UCME - Universidad Complutense de Madrid |
| 14 | Muñoz de los Reyes Isabel | Centro Oceanográfico de Cádiz, IEO - CSIC |
| 15 | Pascual Alayón Pedro José | Instituto Español de Oceanografía |