Gbif.es » Formación y divulgación » II Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)
Taller
Tipo

En línea

Fecha comienzo Taller

07/10/2019

Fecha fin Taller

21/10/2019

Lugar

modalidad online

A cargo de

Alejandro González (RJB-CSIC) y Julia Chacón (INIA)

Idioma

Castellano

Máximo nº de participantes

50

Horas estimadas de dedicación

30

Contacto

info@gbif.es

II Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)

Descripción

Este curso pretende sentar las bases para usar y desarrollar R de una manera autónoma y utilizar el software para manejar, manipular, visualizar y analizar datos de ecología y biodiversidad. Se hace especial énfasis en aquellas herramientas que posibilitan ser un usuario eficiente del programa.

El taller es parte del programa de cursos de especialización del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, que extenderá un certificado de aprovechamiento del mismo para aquellos/as alumnos/as que superen los objetivos marcados.

Metodología

El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (http://elearning.gbif.es/). Combinaremos la impartición de vídeo tutoriales donde, en vídeos muy cortos, explicaremos paso a paso, desde las primeras operaciones con el programa como la gestión de archivos, a los rudimentos del análisis estadístico, la programación para trabajar de manera eficiente o los estilos más modernos de trabajo en el entorno R.

Pasos a seguir para matricularse:
  • Rellenar formulario de inscripción hasta el 10 de septiembre de 2019.
  • Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 13 de septiembre de 2019.
  • La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 17 de septiembre de 2019*.
*Si no se ha recibido confirmación en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente.

Proceso de selección: Las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones y países interesados, por lo que a la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.

Requisitos técnicos del taller: Disponer de un ordenador con al menos 4 GB de memoria RAM. Si existen estudiantes del curso que trabajen en entornos Linux o Mac, rogamos contactar con los docentes (jano@rjb.csic.es) para facilitar las instrucciones de cómo instalar los programas R y Rstudio en sus plataformas.

Conocimientos previos: Este curso está concebido para personas sin conocimientos previos de R o con muchas lagunas. Sin embargo, puede aportar conocimientos a personas interesadas en aprender programación o escritura eficiente de código.

-- evento realizado, materiales disponibles --

Programa

Módulo 0: PRESENTACIÓN DEL CURSO

  • Presentación del profesorado.
  • GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.

Módulo 1: INTRODUCCIÓN

  • Qué es R.
  • Instalación de R.
  • Instalación de R Studio.
  • Partes de R: consola y primeros comandos.
  • Funciones y objetos en R.
  • Partes de R Studio.
  • Optimización de R Studio.
  • Bajada de paquetes.
  • Otras herramientas GUI.

Módulo 2: MANEJO DE DIRECTORIOS

  • Uso de carpetas y ubicaciones.
  • Creación de ficheros y objetos.
  • Empezar con el caso de estudio.

Módulo 3: TIPOS DE OBJETOS

  • Introducción a los tipos de datos y estructuras.
  • Vectores y operaciones con vectores.
  • Matrices.
  • Marcos de datos.
  • Listas y arrays.
  • Operaciones con texto.
  • Otros tipos.

Módulo 4: MANIPULACIÓN DE OBJETOS

  • Operaciones básicas para conocer los objetos.
  • Operaciones de un tipo de dato a otro.
  • Transformación en marcos de datos.
  • Innovaciones en R (tidyverse).
  • Optimización del código mediante el tidyverse.

Módulo 5: GRÁFICOS BÁSICOS

  • Gráficos del paquete básico.
  • Otras operaciones.
  • Ejercicio guiado.

Módulo 6: GGPLOT

  • Filosofía de ggplot.
  • Operaciones básicas de ggplot.
  • Boxplots.
  • Histogramas y densidad.
  • Scatterplots.
  • Barras, etc.
  • Trucos.
  • Leyendas, etiquetas, posiciones.
  • Ejercicio guiado.

Módulo 7: PROGRAMACIÓN EFICIENTE

  • Introducción a la programación y justificación.
  • Bucles for.
  • Bucles while.
  • Condicionales if else.
  • Resolviendo problemas de las simulaciones.
  • Creación de funciones I.
  • Creación de funciones II.
  • Funciones de la familia apply.

Módulo 8: RECURSOS EXTERNOS

  • Ayuda de R.
  • Stack overflow.
  • GitHub.

Módulo 9: PUBLICACIÓN CON R

  • Introducción a R markdown.
  • Generación de trozos de código.
  • Operar con imágenes.
  • Operar con tablas.
  • Operar con índices.
  • Otros tipos.

Módulo 10: INTRODUCCIÓN A LA ESTADÍSTICA

  • Visión general de la estadísitca en R.
  • Primeros pasos de la estadística básica en R.
  • Distribuciones.
  • Obtención de algunos parámetros de los modelos.
  • Estadística no paramétrica.
  • Introducción a modelos más complejos.
  • Ejercicio guiado.

#tallerRonline2019

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Listado de Participantes

Nombre Organización
1 González Montelongo Cristina Herbario TFC. Universidad de La Laguna
2 Scheinsohn Vivian CONICET-INAPL/UBA
3 Calero Blanco Belén Universidade de Vigo-Instituto Español de Oceanografía
4 Cantarell Gabriela Fabiana Sistema de Información de Biodiversidad de la Administración de Parques Nacionales (Argentina)
5 Albero Ruiz Blanca Universidad Autónoma de Madrid (UAM)
6 Salmerón Jiménez Francisca Instituto Español de Oceanografía - Málaga
7 Iriarte Hebe Jorgelina Instituto Multidisciplinario de Investigaciones Biológicas de San Luis - CONICET (Argentina)
8 Mas Gisbert Hugo VAERSA
9 Espinosa Rincón Mónica Junta de Comunidades de Castilla-La Mancha
10 Balsalobre Agustín Centro de Estudios Parasitologicos y de Vectores (CEPAVE-CONICET-UNLP) (Argentina)
11 Ronquillo Ferrero Cristina Museo Nacional de Ciencias Naturales (MNCN-CSIC)
12 Ruiz Guzmán Javier Herbario COFC. Universidad de Córdoba
13 Yañez Agustina Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia"
14 Alcalde Olivares Cristina Junta de Castilla y León - Servicio Territorial de Medio Ambiente de Soria
15 Galvalisi Paola Georgina Instituto de Biología Subtropical (CONICET-UNaM), nodo Posadas (Argentina)
16 Alameda Manzanares Alejandro Agencia de Gestión Agraria y Pesquera de Andalucía
17 Moreno Sancho María del Carmen Tragsatec
18 Baringo Fonseca Clara SiBBR- Brasil
19 Ruiz Reyes Oscar Alburen Consultoría Medioambiental, S.L.
20 Arnal Olivares Alberto-Rafael IMIDRA
21 Coturel Eliana Facultad de Ciencias Naturales y Museo, Universidad Nacional de La Plata (Argentina)
22 Chocho Sánchez Víctor Ministerio del Ambiente (Ecuador)
23 Palero Pastor Ferran Centre d'Estudis Avançats de Blanes (CEAB-CSIC)
24 Souto Domínguez Mónica Novotec Consultores, S.A.
25 Iturribarria Ruiz Marta Gobierno Vasco
26 Buitrago Leonardo SiB Colombia - Instituto Humboldt
27 Lansac Nieto Claudia Real Jardín Botánico (RJB-CSIC)
28 Blanco González Jon Real Jardín Botáncio (RJB-CSIC)
29 Rodríguez Arias Lucía Universidad de Cádiz
30 de la Cruz Muñoz Andrés Universidad de Cádiz
31 Haro Barba Carmen Universidad Rey Juan Carlos - Intermediae Matadero Madrid
32 Juárez Peña Carlos Eduardo Programa de Conservación de Murciélagos de El Salvador (PCMES)-ATVES
33 Solana Mena Alicia Management & Ecology of Malasyan Elephants (MEME, Malasia)
34 Matheu de Cortada Eloïsa Museu de Ciències Naturals de Barcelona
35 López Collar Diego Universidad Complutense de Madrid
36 del Álamo Montes Marina Centro de Colecciones Científicas de la Universidad de Almería (CECOUAL)
37 Peralta Cornejo Francisco José UGR/AECOM
38 Botey Blanca IC5Team
39 Casañas Machín Iván Instituto Español de Oceanografía - Tenerife
40 Languasco María Paola Fundación Miguel Lillo (Argentina)
41 Atienza Ariznavarreta Dacha Consorci Museu de Ciències Naturals de Barcelona
42 Alfaro Saiz Estrella Herbario LEB. Universidad de León
43 Márquez García Francisco Instituto Investigación Agraria Finca La Orden. (CICYTEX) - Herbario HSS
44 Suárez Mayorga Ángela M. Universidad Nacional de Colombia
45 Estrada Chavarría Armando Museo Nacional de Costa Rica
46 Boet Escarceller Olga CREAF
47 Fabado Alós Francisco Javier Jardí Botànic de la Universitat de València
48 Quesada Ochoa Carmen Herbario de la Universidad de Granada
49 García Alonso David Centro de Investigaciones Científicas y Tecnológicas de Extremadura (CICYTEX, Junta de Extremadura)