Gbif.es » Formación y divulgación » II Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad (repetición)
Taller
Tipo

Presencial

Fecha comienzo Taller

14/04/2008

Fecha fin Taller

16/04/2008

Lugar

Aula de Informática del Real Jardín Botánico (CSIC)

A cargo de

Arturo H. Ariño (Univ. Navarra), David Galicia (Univ. Navarra) y Silvia Lusa (GBIF.ES)

Colabora

Francisco Pando (GBIF.ES)

Idioma

Castellano

Máximo nº de participantes

24

Contacto

info@gbif.es

II Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad (repetición)

Descripción:

Este taller tratará el proceso de captura, manejo y publicación en internet de imágenes digitales de especímenes de colección y de otras imágenes relacionadas con proyectos de investigación en biodiversidad: láminas, preparaciones microscópicas, etc.

Los temas a tratar irán desde el equipamiento necesario y su configuración (óptica, iluminación, etc.), las técnicas de captura, el procesado de las imágenes y los (meta)datos a recoger para su publicación.

Los alumnos podrán aportar sus propias imágenes, que se procesarán y se publicarán en un servidor instalado al efecto.

Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
  • Orden de inscripción.
Fecha: 14-16 abril 2008 Con la colaboración de CRIA y de la Universidad de Navarra.

Programa

PARTE I: TÉCNICAS AVANZADAS DE IMAGEN DIGITAL. Arturo H. Ariño y David Galicia.

Lunes 14

9:30-11:00 – Sesión introductoria: Teoría de la imagen digital

1. Nociones básicas sobre imagen

  • Naturaleza de la luz
  • Óptica y formación de la imagen
  • Teoría del Color

2. Captura de una imagen

  • Química de la película fotográfica tradicional
  • Señal analógica y digital
  • Sensores digitales

3. Sistemas de imagen digital

  • Componentes ópticos y electrónicos
  • Equipos de tratamiento de imagen
  • Software de análisis

11:00-11:30 – Pausa para café

11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Adquisición de imagen.

4. Fotografiado de especímenes bidimensionales

  • Ejemplares zoológicos bidimensionales
  • Plantas de herbario
  • Láminas, papel, documentos

5. Fotografiado de especímenes tridimensionales

  • Iluminación
  • Planos y ángulos de imagen
  • Ejemplares de tamaño medio y grande
  • Ejemplares para macrofotografía con SLR
  • Motorización

6. Fotomicroscopía

  • Ejemplares para macrofotografía con estereomicroscopio
  • Microfotografía y técnicas de contraste

7. Casos especiales

  • Cajas de colección
  • Material en líquido
  • Imagen morfométrica

13:30-15:00 Pausa para comer

15:00-16:45 – Sesión teórico-práctica: Prevención de problemas en la imagen

8. Problemas fotográficos

  • Resolución
  • Color
  • Geometría
  • Artefactos

16:45-17:00 – Pausa para café

17:00-18:00

9. Problemas informáticos

  • Pérdida de información
  • Conservación, archivo y durabilidad
  • Costes
  • Compatibilidad de formato

 

Martes 15

09:30-11:00 – Fotografiado de ejemplares de los alumnos

En esta sesión, por turnos y por grupos de casos, los alumnos fotografiarán sus ejemplares de acuerdo a los criterios estudiados el día anterior. Los alumnos que no estén en el laboratorio  tomando las fotos analizarán y criticarán las imágenes del otro grupo, así como las de muestra propuestas por los profesores o las que hayan traído consigo. En la sesión siguiente se abordará el postprocesado, corrección digital y realce.

11:00-11:30 – Pausa para café

11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Postprocesado y análisis de imagen. Corrección.

10. Procesos generales de la imagen

  • Reencuadre y recorte de imagen
  • Redimensionamiento
  • Ajuste de gama dinámica
  • Corrección cromática
  • Corrección geométrica
  • Limpieza digital
  • Ajuste de la nitidez

11. Retoque fotográfico

  • Tratamientos parciales en la imagen
  • Extracción de fondo
  • Filtros

12. Combinaciones de imágenes

  • Álgebra de imagen
  • Montaje fotográfico
  • Stacks y Automontaje

13:30h–15:00 – Pausa para comer

15:00-18:00–  Sesión flexible con tiempo para continuar el fotografiado de ejemplares problema y tratamiento de formatos de imagen y metadatos

13. Formatos de imagen

  • Formatos digitales sin pérdida
    • RAW
    • BMP
    • TIFF
  • Formatos de compresión con pérdida única
    • GIF
    • CCIT
  • Formatos de compresión con pérdida acumulativa
    • JPG

14. Metadatos

  • EXIF
  • Bases de datos de imagen
  • Historial de proceso
  • Documentación
  • IPR
  • Trazabilidad

PARTE II: EL PROCESO DE PUBLICACIÓN DE IMÁGENES DIGITALES EN INTERNET. Silvia Lusa

Miércoles 16

9.30 – 11:00

Proyectos y bibliotecas digitales en Internet

  • El ejemplo de Flora brasiliensis
    • La obra y El proyecto
    • Proceso de digitalización, organización del banco de imágenes y metadatos
    • Sitio web. Flora brasiliensisFlora brasiliensis revisada. Integración con búsquedas externas.
  • Otros proyectos (Biblioteca digital del Real Jardín Botánico, Herbario de Berlín, Morphobank, etc.)

Repositorio de archivos vs Servidor de imágenes (e-Rez, iseemedia).

Visualizadores (zoomyfer, FSI Viewer).

11:00- 11:30 Pausa para café

11:30-13:30 Parte práctica: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.

  • Caso práctico I

Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos en un servidor de imágenes

  • Caso práctico II

Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos con el visualizador zoomyfer

Listado de Participantes

Nombre Organización
1 Martín Ciudad Antonio CSIC-Real Jardín Botánico
2 Lattig Patricia Universidad Autónoma Madrid
3 Borges Rita Universidade do Algarve
4 Macías Palomo Ana Universidad Politécnica Madrid
5 López Luque Raquel Estación Biológica Doñana
6 Bernal Garzón Rocío Astrid Universidade do Porto
7 Férriz Murillo Inmaculada Associacio TAIB
8 Higuera Díaz Diego Fernando www.sentidonatural.org
9 Aru Bárbara Universidad de León
10 Yuste Salguero Manuel Universidad de Almería
11 Hernández Plaza María Eva Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
12 Lusa Bernal Ester Real Jardín Botánico Madrid (CSIC)
13 Hernández Javier Laura Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
14 San Segundo González Laura Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
15 García Díez Teresa Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC)
16 López González Beatriz Universidad de Salamanca
17 García Sánchez José Universidad de Málaga, Dpto. Biología Vegetal, Fac. Ciencias. [Herbario]
18 Cezón García Katia CSIC-Real Jardín Botánico
19 Conejero Ortega Natalia Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva (Valencia)
20 Ramos Arsénio Pedro Miguel Universidade Técnica de Lisboa
21 Pérez Hidalgo Nicolás Universidad de León
22 Navarro Cerveró Lara Universidad de Valencia
23 Rey Fraile Isabel Museo Nacional de Ciencias Naturales (CISC)