Introducción al programa VegAna para la gestión y análisis de datos florísticos y ecológicos
Descripción:
Curso introductorio a VegAna (Vegetation edition and Analysis). Se trata de un paquete integrado de programas destinado a la gestión y análisis de datos ecológicos en general y muy especialmente de vegetación. Contiene 4 programas principales entrelazados:
- Ginkgo: orientado a la representación y clasificación de individuos a partir de datos multivariantes.
- Quercus: es un editor de tablas de datos de tipo inventario. Permite la introducción y gestión de inventarios de especies.
- Fagus: Es un editor y gestor de citas florísticas. Se pueden almacenar datos inéditos, bibliográficos y de colecciones.
- Yucca: Permite la representación cartográfica de los datos, principalmente distribuciones de taxones y grupos de áreas.
Podrá encontrar más información en: http://biodiver.bio.ub.es/vegana, donde se encuentran también las instrucciones de uso de cada programa.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Programa
Lunes 21 de diciembre de 2009
9:30 - 11:00
Bienvenida e introducción al curso
GBIF e información primaria sobre biodiversidad
Generalidades: Visión general del proyecto VegAna. Instalación de los módulos y prerrequisitos del sistema. Ficheros de un proyecto de trabajo, configuración, descarga y actualización de tesauros (taxonómicos y sintaxonómicos).
11:00 - 11:30 Pausa café
11:30 - 13:30
Módulo Fagus: Introducción de citas florísticas (observaciones de campo, pliegos de herbario y citas bibliográficas), importación de datos TXT y XML (Anthos, BDBC, BioCase y GBIF).
13:30 - 15:00. Pausa comida.
15:00 - 17:00
Módulo Zamia: Instalación del programa en una PDA conexión con un GPS. Demostración de la toma de datos (observaciones e inventarios) en el campo (Jardín Botánico).
Módulo Yucca: Importación de mapas y calibrado de imágenes cartográficas. Uso de capas WMS. Elaboración de mapas de distribución.
17:00 - 17:20 Pausa para café
17:20 - 19:00.
Módulo Fagus: Edición de tesauros. Impresión de etiquetas, elaboración de floras y documentos. Elaboración y análisis de datos. Cartografía de especies.
Martes 22 de diciembre de 2009
9:00 - 11:00
Módulo Quercus: Informatización de inventarios de vegetación. Importación de inventarios en formato xml (BDBC y SIVIM). Edición de tablas de inventarios y tablas sintéticas. Análisis manual y automatizado de tablas. Espectros biológicos. Cartografía de comunidades. Exportación de citas florísticas a Fagus.
11:00 - 11:30 Pausa café
11:30 - 13:30
Módulo Quercus: Análisis manual y automatizado de tablas. Espectros biológicos. Cartografía de comunidades. Exportación de citas florísticas a Fagus.
13:30 - 15:00. Pausa comida.
15:00 - 17.00
Módulo Ginkgo: Importación/exportación de datos. Cálculo de índices de similaridad/disimilaridad.Introducción al análisis multivariante de datos. Métodos de ordenación (PCA, PcoA y CA) y métodos de clasificación jerárquicos y no jerárquicos (K-means y Fuzzy C-means. Estudio de la fidelidad de las especies a las comunidades.
17:00 - 17:30
Evaluación, aclaración de dudas y cierre del curso.
Documentos Adjuntos
Vídeos del tallerEnlaces de Interés
http://biodiver.bio.ub.es/vegana/castellano/index.htmlDocumentos de Interés
Proyecto Fagus empaquetado Presentación http://biodiver.bio.ub.es/FontMaster2008/UTM-Catalunya.txt Var. ambientales Cataluña Fidelidad Modelo de tesauro a importar a Vegana K-means Formato importación de tablasListado de Participantes
Nº | Nombre | Organización |
---|---|---|
1 | Garófano Gómez Virginia | |
2 | Laguna Defior Clara | |
3 | Galicia Herbada David | |
4 | de la Torre Llorente Daniel | |
5 | Rodríguez García Alberto | |
6 | Hernández Palacios Gonzalo | |
7 | Rodríguez Rojo María Pilar | |
8 | Prieto Amador | |
9 | Fernández Calzado Mª Rosa | |
10 | Errea Abad Maria Paz | |
11 | Fernández Fernández Juan Gabriel | |
12 | Rubio Teso María Luisa | |
13 | Chacón Labella Julia | |
14 | Castillejo Moreno José Miguel | |
15 | González Oreja José Antonio | |
16 | López González Beatriz | |
17 | Lado Rodríguez Carlos | MYXOTROPIC. Myxobiota Neotropical. Estudio biosistemático de Myxomycetes de las zonas áridas |
18 | García San León David | Universidad de Santiago de Compostela, Laboratorio de Botánica, Fac. Farmacia. [Herbario] |
19 | Ibáñez Gastón Ricardo | Universidad de Navarra. Departamento de Biología Ambiental |