IX Taller GBIF de Modelización de Nichos Ecológicos
Descripción:
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
El taller será retransmitido en directo a través del canal de la Cienciatk. Para el buen seguimiento de la retransmisión se recomienda:
- Instalar y/o actualizar QuickTime http://www.apple.com/es/quicktime/download/
- Utilizar Mozilla Firefox o Google Chrome
- Tener una conexión a Internet medianamente rápida
- Abrir los puertos tcp 554, 7070, 8554 y udp 554 en caso de que el cortafuegos (firewall) de la institución esté bloqueando el acceso.
Para obtener más información sobre posibles problemas en la retransmisión haga clic aquí: http://www.cienciatk.csic.es/preguntas_frecuentes/
A través del twitter de GBIF España @GbifEs (https://twitter.com/GbifEs) se podrán enviar preguntas sobre la materia impartida durante el curso. La etiqueta (hashtag) para el taller será: #TallerModelos. Cada dáa se hará una selección de 3 o 4 preguntas que serán respondidas a última hora del taller, de 16:30h a 18:00h, por el instructor del curso. El viernes día 31 de 11:30h a 13h está prevista una discusión con Jorge Lobo (MNCN) sobre técnicas de calibrado y evaluación.
Programa
Martes 28 de Mayo (introducción a los modelos y las herramientas SIG)
09:30 - 10:00 Presentación del taller: organización y planificación. Marco del taller: GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
10:00 - 11:00 Introducción a los Modelos de Nicho Ecológico
- Concepto de Modelo
- El Nicho Ecológico
- La Distribución Geográfica de las especies
- Modelos de Nicho Ecológico
- Definición
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 13:30 Introducción a los Modelos de Nicho Ecológico (continuación)
- Proceso de modelado
- Formulación teórica
- Registros de presencia
- Variables ambientales
- Análisis de viabilidad de los datos
- Algoritmos predictivos
- Parámetros del modelo
- Evaluación
- Post-procesamiento y análisis
- Interpretación de los resultados y aplicación
- Aplicaciones
- Limitaciones
13:30 - 15:00 Pausa para comer
15:00 - 16:30 Conceptos básicos de SIG (teoría y práctica con Quantum GIS):
- Sistemas de referencia
- Modelos vectorial y raster
- Operaciones espaciales
- Gestión de registros de presencia
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 – 18:00 Conceptos básicos de SIG (continuación)
- Gestión de variables ambientales
Miércoles 29 de Mayo (teoría y práctica con algoritmos predictivos)
09:00 - 11:00 OpenModeller, teoría y práctica.
- Fundamentos de los algoritmos predictivos incluidos en OpenModeller
- Calibrado y evaluación de modelos con OpenModeller
- Proyección de modelos con OpenModeller
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 – 13:30 MaxEnt, teoría y práctica
- Fundamentos del algoritmo
- Calibrado y evaluación de modelos con MaxEnt
- Proyección de modelos con MaxEent
13:30 - 15:00 Pausa para comer
15:00 – 16:30 Dismo (R), teoría y práctica
- Fundamentos de los algoritmos predictivos incluidos en Dismo (R)
- Calibrado y evaluación de modelos con Dismo (R)
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 – 18:00 Ensamblado de modelos
Jueves 30 de Mayo - Taller de trabajo individual o en grupo
09:00 - 10:00 Dinámica del taller
- Explicación de la dinámica del taller
- Presentación de los casos de trabajo y los datos necesarios
- Formación de grupos y asignación de casos
10:00 - 11:00 Taller
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 – 13:30 Taller
13:30 - 15:00 Pausa para comer
15:00 – 16:30 Taller
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 – 18:00 Taller
Viernes 31 de Mayo
09:00 - 10:00 Acabado de los casos prácticos
10:00 - 11:00 Presentación de los resultados (discusión de limitaciones de los modelos y nuevas direcciones de trabajo)
11:00 - 11:30 Descanso
11:30 - 13:00 Discusión con Jorge Lobo (MNCN) sobre técnicas de calibrado y evaluación
13:00 - 13:30 Discusión final, evaluación y cierre del Taller
#TallerModelos
Ver más en twitterDocumentos Adjuntos
01.- Introducción a los Modelos de Nicho Ecológico - Blas Benito - (Video en YouTube) 02.- El proceso de modelado (I) - Blas Benito - (Video en YouTube) 03.- El proceso de modelado (II) - Blas Benito - (Video en YouTube) 04.- Aplicaciones de modelos de distribución - Blas Benito - (Video en YouTube) 05.- El entorno de trabajo - Blas Benito - (YouTube) 06.- Introducción básica a los SIG - Blas Benito - (Video en YouTube) 07.- Fundamentos de Quantum Gis y Grass (I) - Blas Benito - (Video en YouTube) 08.- Fundamentos de Quantum Gis y Grass (II) - Blas Benito - (Video en YouTube) 09.- Fundamentos de R - Blas Benito - (Video en YouTube) 10.- Análisis de correlación de variables predictivas con R - Blas Benito - (Video en YouTube) 11.- Openmodeller y Evaluación de modelos I - Blas Benito - (Video en YouTube) 12.- Openmodeller y Evaluación de modelos II - Blas Benito - (Video en YouTube) 13.- Modelos Lineales Generalizados (GLM) - Blas Benito - (Video en YouTube) 14.- Fundamentos de Random Forest 15.- Discusión sobre técnicas de calibrado y evaluación (I) - Jorge Lobo - (Video en YouTube) 16.- Discusión sobre técnicas de calibrado y evaluación (II) - Jorge Lobo - (Video en YouTube)Documentos de Interés
Materiales utilizados en el taller - Blas Benito Materiales utilizados en el taller - Jorge Lobo - (.pdf) R para principiantes (archivo .pdf; 347 Kb)Listado de Participantes
Nº | Nombre | Organización |
---|---|---|
1 | Zufiaurre Martinez Aitziber | Sociedad de Ciencias Aranzadi |
2 | Cabra Rivas Isabel | Universidad de Alcalá |
3 | Sua Tunjano Sonia | Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas Sinchi, Colombia |
4 | Canepa Oneto Antonio Jesús | Instituto de Ciencias del Mar (ICM-CSIC) Barcelona |
5 | Rivera Martínez Jesús | Instituto Español de Oceanografía. Madrid |
6 | Garrote Alonso Germán | Junta de Andalucía |
7 | Zapata Ramírez Paula Andrea | Universidad Politecnica de la Marche, Italia |
8 | Mougeot Francois | CSIC, EEZA |
9 | García-Alegre Garralda Ana | Centro Oceanográfico de Santander |
10 | Sevilla Callejo Miguel | Instituto Pirenaico de Ecología – CSIC |
11 | García Martín Joaquina María | CSIC-Real Jardín Botánico |
12 | Bruque Carmona Gerardo | Centro Oceanográfico de Málaga |
13 | Fandos Guzmán Guillermo | Universidad Complutense Madrid |
14 | Iglesias Merchán Carlos | Universidad Politécnica Madrid |
15 | Casabó Escrig Joan | Jardí Botànic de la Universitat de València |
16 | Mairal Pisa Mario | CSIC-Real Jardín Botánico |
17 | Sánchez Aparicio Carolina | Tragsatec |
18 | Fabado Alós Francisco Javier | Universidad de Valencia-Jardín Botánico |
19 | de Castro Santos Amable | Universidad de Granada, Servicio de Herbario de la Universidad de Granada [Herbario] |
20 | Peña Freire Viviana | Universidade da Coruña |
21 | Aparicio Sánchez José Ignacio | Botanisches Institut Karlsruhe, Alemania |
22 | Ramos Arsénio Pedro Miguel | Herbário João de Carvalho e Vasconcellos, Portugal |
23 | Martínez García Felipe | Universidad Politécnica Madrid |
24 | Ibáñez Gastón Ricardo | Universidad de Navarra. Departamento de Biología Ambiental |