Taller online GBIF.ES: Estandarización y publicación de datos ecológicos a largo plazo (LTER)
Descripción
Este taller teórico-práctico tiene como objetivo mejorar la capacidad de los participantes para preparar y publicar datos de biodiversidad utilizando como hilo conductor los procedimientos y portales de GBIF. Se abordarán aspectos relativos a la calidad, limpieza y depuración de los datos, estandarización y publicación a través de la herramienta Integrated Publishing Toolkit (IPT), así como la preparación de manuscritos para la publicación de data papers. El taller está organizado por GBIF.ES en colaboración con la PTI del CSIC ECOBIODIV y la comunidad LTER, está especialmente dirigido a investigadores/as que manejan datos ecológicos a largo plazo.Metodología
El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (https://elearning.gbif.es/). Los contenidos del curso serán una combinación de vídeos, presentaciones y casos prácticos. Se estima que el tiempo necesario para completar el curso es equivalente a 30 horas lectivas, que se podrán repartir de manera libre a lo largo de las dos semanas de duración del curso. Los participantes podrán interaccionar con los docentes y el resto de participantes a través del foro de la plataforma e-learning y de una sesión interactiva.Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar formulario de inscripción hasta el 23 de agosto de 2021.
- Publicación de lista de alumnos/as en la página web del taller primera semana de septiembre de 2021.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Manejo de datos potencialmente publicables en GBIF.
- Experiencia en Estudios o proyectos que incluyan la toma de datos ecológicos a largo plazo.
- Capacidad de difusión de los contenidos del taller.
- Adscripción a una institución/instituto que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- En el taller se manejarán archivos .csv y .txt.
- Se requerirá el uso de Microsoft Office Access.
- Es recomendable tener un juego de datos propio para realizar algunos de los casos prácticos del taller.
- Todos los materiales (vídeos y presentaciones) estarán disponibles para su descarga una vez concluya el taller.
-- evento realizado, materiales disponibles --
Programa
MÓDULO 0: INTRODUCCIÓN
- Ciencia, datos, resultados e infraestructuras - Francisco Pando (GBIF.ES)
- Experiencia de publicación de datos ecológicos a largo plazo - Andrea Ros Candeira (Observatorio de Cambio Global de Sierra Nevada)
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad - Cristina Villaverde (GBIF.ES)
MÓDULO 1: CONCEPTOS GENERALES
Introducción a la publicación de datos de biodiversidad - Katia Cezón (GBIF.ES) / Dairo Escobar (SiB Colombia)
Flujo general de publicación de datos de biodiversidad en los portales de GBIF - Katia Cezón (GBIF.ES)
MÓDULO 2: ESTANDARIZACIÓN Y PREPARACIÓN DE LOS DATOS PARA SU PUBLICACIÓN
Estándares - Paula Zermoglio (Universidad de Buenos Aires/Vertnet) y Katia Cezón (GBIF.ES)
- Conceptos de estándares: tipos, vocabularios, fuentes
- Estándar Darwin Core
- Extensiones Darwin Core
- Darwin Core Archive
- Introducción al IPT (Integrated Publishing Toolkit)
Caso práctico 01 - Adaptación al estándar Darwin Core
Conceptos básicos de la calidad y limpieza de datos de biodiversidad (definiciones y aspectos teóricos importantes) - Paula Zermoglio (Universidad de Buenos Aires/Vertnet) y Katia Cezón (GBIF.ES)
Herramientas útiles para la calidad y limpieza de los datos - Katia Cezón (GBIF.ES)
Prácticas con herramientas para la limpieza y control de la calidad de los datos
- Caso práctico 02 - Herramientas para la gestión de nombres científicos - Species Matching
- Caso práctico 03 - Herramientas para la gestión de nombres científicos - Name Parser
- Caso práctico 04 - Herramientas para el tratamiento de las fechas
- Caso práctico 05 - Herramientas para la conversión de coordenadas
- Caso práctico 06 - Herramientas para la validación de datos - Validador de datos de GBIF
MÓDULO 3: PUBLICACIÓN DE DATOS EN EL SISTEMA DE GBIF
Licencias de Uso de los Datos - Francisco Pando
Introducción al IPT (Integrated Publishing Toolkit) como herramienta de publicación y ejemplo guiado - Katia Cezón (GBIF.ES)
Caso práctico 07 - Prácticas de publicación a través del IPT con datos de ejemplo
- Prácticas de publicación con juegos de datos de tipo registros de presencia, evento de muestreo y checklist.
- Prácticas de publicación avanzada (mediante el uso de extensiones de información para complementar la información anterior).
Caso práctico 08 - Prácticas de publicación a través del IPT con datos propios
¿Cómo se verán los datos una vez publicados? Portales de GBIF.org y datos.gbif.es - Cristina Villaverde (GBIF.ES)
MÓDULO 4: PUBLICACIÓN DE ARTÍCULOS DE DATOS (“DATA PAPERS”)
Introducción a los data papers: qué son y por qué publicarlos - David Galicia (Univ. Navarra) y Nora Escribano (Univ. Navarra)
- Costes asociados a la generación de un recurso - David Galicia (Univ. Navarra)
- Incentivos para la publicación de datos - David Galicia (Univ. Navarra)
- Objetivo y estructura de un data paper - David Galicia (Univ. Navarra)
- Plataforma ARPHA - Nora Escribano (Univ. Navarra)
Caso práctico 09: Elaboración de un data paper con la herramienta online Arpha.
Evaluación del curso.
#tallerGBIFDatosEcologicos
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Vídeos de los contenidos del tallerListado de Participantes
Nº | Nombre | Organización |
---|---|---|
1 | Moreno Martínez Sonia | TRAGSATEC |
2 | Palacios Ojeda Sebastián | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
3 | Márquez Ferrando Rocío | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
4 | Ávila Castuera José Manuel | LifeWatch ERIC |
5 | Marquez Gonzalo | Universidad Nacional de La Plata (Argentina) |
6 | Mellado García Ana | Observatorio de Cambio Global de Sierra Nevada, UGR |
7 | Núñez Trujillo Garoé | Gesplan |
8 | Lizarraga Leonidas | Administración de Parques Nacionales (Argentina) |
9 | Bravo Utrera Miguel Ángel | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
10 | Ariza Mateos David | Universidad de Córdoba |
11 | Martínez Blanco Antonio | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
12 | Canellas Isabel | INIA, CSIC |
13 | Alberdi Asensio Iciar | INIA, CSIC |
14 | González Moreno Pablo | Universidad de Córdoba |
15 | Ruiz Gómez Francisco José | Universidad de Córdoba |
16 | Díaz-Delgado Ricardo | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
17 | Palacios Rodríguez Guillermo | Universidad de Córdoba |
18 | Carro Mariño Francisco | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
19 | García Álvarez Salvia | Herbario EMMA, E.T.S.I. Montes, Forestal y del Medio Natural, UPM |
20 | Iriarte Hebe Jorgelina | IMIBIO - CONICET y Micoteca MICODIF (Argentina) |
21 | Blanco Aguiar José Antonio | IREC (CSIC-UCLM) |
22 | García Ivana Mariel | IRNAD, UNRN-CONICET (Argentina) |
23 | Machado Ana Sofía | CONICET-UNC (Argentina) |
24 | Ferrer Montserrat | Museu de Ciències Naturals de Barcelona |
25 | Fernández Zamudio Rocío | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
26 | Sandoval Cortés Pedro José | Universidad de Granada |
27 | Boet Escarceller Olga | CREAF |
28 | Aguayo Becerra Daniel | Universidad de Granada |