XI Taller GBIF de Modelización de Nichos Ecológicos
Descripción:
La Unidad de Coordinación de GBIF en España organiza el un décimo taller de modelización de nichos ecológicos. En este taller práctico se estudiarán los conceptos básicos para poder realizar modelos de distribución mediante herramientas como R (Dismo) y MaxEnt. Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
El taller será retransmitido en directo a través del canal de la Cienciatk. Para el buen seguimiento de la retransmisión se recomienda:
- Instalar y/o actualizar QuickTime http://www.apple.com/es/quicktime/download/
- Utilizar Mozilla Firefox o Google Chrome
- Tener una conexión a Internet medianamente rápida
- Abrir los puertos tcp 554, 7070, 8554 y udp 554 en caso de que el cortafuegos (firewall) de la institución esté bloqueando el acceso.
Para obtener más información sobre posibles problemas en la retransmisión haga clic aquí: http://www.cienciatk.csic.es/preguntas_frecuentes/
Programa
Martes 24 de Febrero: Introducción y preparación de variables y presencias
09:30 - 10:00 Presentación del taller: organización y planificación. Marco del taller: GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
10:00 - 11:00 Introducción a los Modelos de Nicho Ecológico
- Concepto de Modelo
- La Distribución Geográfica de las especies
- El Nicho Ecológico
- Modelos de Nicho Ecológico
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 12:30 Introducción a los Modelos de Nicho Ecológico (continuación)
- Proceso de modelado
- Formulación teórica
- Registros de presencia
- Variables ambientales
- Análisis de viabilidad de los datos
- Algoritmos predictivos
- Parámetros del modelo
- Evaluación
- Post-procesamiento y análisis
- Interpretación de los resultados y aplicación
- Aplicaciones
- Limitaciones
12:30 - 13:30 Conceptos básicos de SIG (teoría y práctica con Quantum GIS)
- Sistemas de referencia
- Modelos vectorial y raster
- Operaciones espaciales
13:30 - 15:00 Pausa para comer
15:00 – 16:30 Preparación de variables ambientales
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 – 18:00 Preparación de registros de presencia
Miércoles 25 de Febrero: Teoría y práctica con algoritmos predictivos
09:00 - 11:00 Modelos de distribución con R y Dismo, teoría y práctica: GLM, GAM, Random Forest
- Fundamentos de los algoritmos predictivos incluidos en Dismo
- Calibrado, evaluación y proyección de modelos Dismo
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 – 13:30 Modelos de distribución con R y Dismo (continuación)
13:30 - 15:00 Pausa para comer
15:00 – 16:30 Modelos de distribución con MaxEnt, teoría y práctica
- Fundamentos del algoritmo
- Calibrado, evaluación y proyección de modelos con MaxEnt
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 – 18:00 Modelos de distribución con MaxEnt (continuación)
Jueves 26 de Febrero: Taller de trabajo práctico
09:00 - 10:00 Taller de trabajo individual o en grupo
- Explicación de la dinámica del taller
- Presentación de los casos de trabajo y los datos necesarios
- Formación de grupos y asignación de casos
10:00 - 11:00 Taller
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 – 13:30 Taller
13:30 - 15:00 Pausa para comer
15:00 – 16:30 Taller
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 – 18:00 Taller
Viernes 27 de Febrero : presentación de casos del taller, modelos dinámicos y cierre
09:00 - 11:00 Presentación de los resultados (discusión de limitaciones de los modelos y nuevas direcciones de trabajo)
11:00 - 11:30 Descanso
11:30 - 13:00 Modelos de distribución dinámicos (teoría y ejemplo práctico)
13:00 - 13:30 Discusión final, evaluación y cierre del Taller
#TallerModelos2015
Ver más en twitterDocumentos Adjuntos
01.-Introducción a los Modelos de Nicho Ecológico - Blas Benito - (Video en YouTube) 02.-El proceso de modelado - Blas Benito - (Video en YouTube) 03.-El entorno de trabajo (I): Introducción a R - Blas Benito - (Video en YouTube) 04.-El entorno de trabajo (II): trabajo con datos raster - Blas Benito - (Video en YouTube) 05.-Preparación de las variables predictivas y los registros de presencia - Blas Benito - (YouTube) 06.-Preparación de las variables predictivas. CASO PRÁCTICO - Blas Benito - (Video en YouTube) 07.-Preparación de los registros de presencia. CASO PRÁCTICO - Blas Benito - (Video en YouTube) 08.-Preparación de los registros de presencia. CASO PRÁCTICO (cont.) - Blas Benito - (Video en YouTube) 09.-Aprendiendo a modelizar (I): GLM's - Blas Benito - (Video en YouTube) 10.-Aprendiendo a modelizar (II): GAM y Random Forest - Blas Benito - (Video en YouTube) 11.-Aprendiendo a modelizar (III): Ensamblado de modelos 12.-Aprendiendo a modelizar (IV): Evaluación de modelos - Blas Benito - (Video en YouTube) 13.-Aprendiendo a modelizar (V): Aplicación de umbrales de corte - Blas Benito - (Video en YouTube) 14.-Proyección de modelos de distribución en el tiempo y en el espacio -Blas Benito - (Video en YouTube) 15.-Introducción a MAXENT - Blas Benito - (Video YouTube) 16.-Introducción a MAXENT (cont.) - Blas Benito - (Video YouTube) 17.-Taller de trabajo: presentación de los casos prácticos - Blas Benito - (Video en YouTube)Documentos de Interés
Sesión 01: Introducción y preparación de variables y presencias - Blas Benito (.pdf) Sesión 02: Teoría y práctica con algoritmos predictivos - Blas Benito (.pdf) Sesión 03: Introducción y preparación de variables y presencias - Blas Benito (.pdf) Bibliografía (archivo .zip; 38,2 Mb) Archivos para realizar los ejemplos de las sesiones 1, 2 y 3 (.zip)Listado de Participantes
Nº | Nombre | Organización |
---|---|---|
1 | Andrés Ros José Vicente | Consultor ambiental Gobierno Aragón |
2 | Prieto Bonastre Laura | Universidad Rey Juan Carlos |
3 | Carbonell Alanís Roberto | Universidad Complutense de Madrid |
4 | González Agejas Inmaculada | MAGRAMA |
5 | Morente López Javier | Universidad Rey Juan Carlos |
6 | Rodríguez Merino Argantonio | Universidad de Sevilla / Real Jardín Botánico – CSIC |
7 | García Redondo Verónica | Universidade da Coruña |
8 | Mata Chacón Dulce | Universidad Complutense de Madrid |
9 | Moreno Rueda Gregorio | Universidad de Granada |
10 | Otero Gómez Ana | CSIC-Real Jardín Botánico |
11 | Aulló Maestro Isabel Consuelo | Universidad Politécnica de Madrid |
12 | Buira Clua Antoni | CSIC-Real Jardín Botánico |
13 | Fernández Cancio Ángel | INIA |
14 | Ramos López Beatriz | Universidad de Alcalá |
15 | de la Cruz Calleja Ana Carmen | Instituto Nacional de Investigaciones Agrarias. Centro de Investigación Forestal |
16 | Ponti de la Iglesia Raquel | Museo Nacional Ciencias Naturales – CSIC |
17 | Agudo García Alicia | CSIC-Real Jardín Botánico |
18 | Zuñiga Rival Mireya | Universidad de Barcelona |
19 | Garin Barrio Ion | Sociedad de Ciencias Aranzadi |
20 | Ríos López Pilar | Centro Oceanográfico de Gijón. Instituto Español de Oceanografía. |
21 | Hernández Palacios Gonzalo | Universidad Castilla-La Mancha |
22 | Lumbreras Corujo Ana | Universidad de Évora |
23 | García Sánchez José | Universidad de Málaga, Dpto. Biología Vegetal, Fac. Ciencias. [Herbario] |
24 | Gómez García Daniel | IPE - CSIC |