I Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)
Descripción
Este curso pretende sentar las bases para usar y desarrollar R de una manera autónoma y utilizar el software para manejar, manipular, visualizar y analizar datos de ecología y biodiversidad. Se hace especial énfasis en aquellas herramientas que posibilitan ser un usuario eficiente del programa.
Metodología
El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (http://elearning.gbif.es/). Combinaremos la impartición de vídetutoriales donde, en vídeos muy cortos, explicaremos paso a paso, desde las primeras operaciones con el programa como la gestión de archivos, a los rudimentos del análisis estadístico, la programación para trabajar de manera eficiente o los estilos más modernos de trabajo en el entorno R.
Pasos a seguir para matricularse:
- Rellenar formulario de inscripción hasta el 31 de octubre de 2018.
- Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 5 de noviembre de 2018.
- La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los alumnos admitidos para facilitarles el modo de pago para formalizar la matrícula del taller.
- Realizar ingreso siguiendo los pasos que se indiquen hasta el 12 de noviembre de 2018*.
- Enviar a infogbifspain@gmail.com el justificante de pago que será la entrada del curso que generará la lanzadera de pago. Esto se explicará en detalle vía email a las personas admitidas.
Proceso de selección: Las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones y países interesados, por lo que a la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
Requisitos técnicos del taller: Disponer de un ordenador con al menos 4 GB de memoria RAM. Si existen estudiantes del curso que trabajen en entornos Linux o Mac, rogamos contactar con los docentes (jano@rjb.csic.es) para facilitar las instrucciones de cómo instalar los programas R y Rstudio en sus plataformas.
Conocimientos previos: Este curso está concebido para personas sin conocimientos previos de R o con muchas lagunas. Sin embargo puede aportar conocimientos a personas interesadas en aprender programación o escritura eficiente de código.-- evento realizado, materiales disponibles --
Programa
Módulo 0: PRESENTACIÓN DEL CURSO
- Presentación del profesorado.
- GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
Módulo 1: INTRODUCCIÓN
- Qué es R.
- Instalación de R.
- Instalación de R Studio.
- Partes de R: consola y primeros comandos.
- Funciones y objetos en R.
- Partes de R Studio.
- Optimización de R Studio.
- Bajada de paquetes.
- Otras herramientas GUI.
Módulo 2: MANEJO DE DIRECTORIOS
- Uso de carpetas y ubicaciones.
- Creación de ficheros y objetos.
- Empezar con el caso de estudio.
Módulo 3: TIPOS DE OBJETOS
- Introducción a los tipos de datos y estructuras.
- Vectores y operaciones con vectores.
- Matrices.
- Marcos de datos.
- Listas y arrays.
- Operaciones con texto.
- Otros tipos.
Módulo 4: MANIPULACIÓN DE OBJETOS
- Operaciones básicas para conocer los objetos.
- Operaciones de un tipo de dato a otro.
- Transformación en marcos de datos.
- Innovaciones en R (tidyverse).
- Optimización del código mediante el tidyverse.
Módulo 5: GRÁFICOS BÁSICOS
- Gráficos del paquete básico.
- Otras operaciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 6: GGPLOT
- Filosofía de ggplot.
- Operaciones básicas de ggplot.
- Boxplots.
- Histogramas y densidad.
- Scatterplots.
- Barras, etc.
- Trucos.
- Leyendas, etiquetas, posiciones.
- Ejercicio guiado.
Módulo 7: PROGRAMACIÓN EFICIENTE
- Introducción a la programación y justificación.
- Bucles for.
- Bucles while.
- Condicionales if else.
- Resolviendo problemas de las simulaciones.
- Creación de funciones I.
- Creación de funciones II.
- Funciones de la familia apply.
Módulo 8: RECURSOS EXTERNOS
- Ayuda de R.
- Stack overflow.
- GitHub.
Módulo 9: PUBLICACIÓN CON R
- Introducción a R markdown.
- Generación de trozos de código.
- Operar con imágenes.
- Operar con tablas.
- Operar con índices.
- Otros tipos.
Módulo 10: INTRODUCCIÓN A LA ESTADÍSTICA
- Visión general de la estadísitca en R.
- Primeros pasos de la estadística básica en R.
- Distribuciones.
- Obtención de algunos parámetros de los modelos.
- Estadística no paramétrica.
- Introducción a modelos más complejos.
- Ejercicio guiado.
#tallerRonline2018
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Listado YouTube de vídeos con las lecciones del taller Archivo comprimido con las presentaciones y materiales utilizados durante el tallerList of participants
Nº | Name | Organization |
---|---|---|
1 | Zorrozua Gamboa Nere | Sociedad de Ciencias Aranzadi |
2 | Torre Casado Salustiano | Real Jardín Botánico - CSIC |
3 | Robles Vallet Carmen María | IFAPA (Instituto de Investigación Agraria y Pesquera) |
4 | Ortiz Díaz Laura | Universidad Rey Juan Carlos |
5 | Muñoz García Joaquín | Estación Biológica de Doñana, CSIC |
6 | Martínez Pérez Sandra | CIBIO - Universidad de Alicante |
7 | Marmaneu Palero José María | CIBIO - Universidad de Alicante |
8 | Maestre Zuazua Zuriñe | Sociedad Pública de Gestión Ambiental del Gobierno Vasco (IHOBE) |
9 | Lorenzo Rodríguez Paula | Centre for Functional Ecology - Science for People & the Planet (Universidade de Coimbra) |
10 | Lijó Pose Gabriel | Empresa privada |
11 | González Rodríguez Luís | Universidade de Vigo |
12 | González Forero Manuela | Estación Biológica de Doñana, CSIC |
13 | Gómez Serrano Miguel Ángel | VAERSA / Servicio de vida Silvestre. Conselleria de Agricultura, Medio Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural |
14 | Esquete Garrote Patricia | Universidad de Aveiro |
15 | Elcano Delgado Irene | Universidad Autónoma de Madrid |
16 | Checa Herranz Lucía | Universidad Rey Juan Carlos |
17 | Caro Miralles Elvira | Universidad Rey Juan Carlos |
18 | Instituto Español de Oceanografía (Cádiz) | |
19 | Belda Aguilar Ignacio | Universidad Rey Juan Carlos |
20 | Álvarez Muñiz Clara | Universidad Rey Juan Carlos |
21 | Barberá Sánchez Patricia | Missouri Botanical Garden / Real Jardín Botánico - CSIC |
22 | Rives Pérez Borja | Unversidad de Barcelona |
23 | Zas de Uña Emilia | Instituto Español de Oceanografía y Empresa Investigación, Planificación y Desarrollo. |
24 | Bernardo Nicola | Estación Biológica de Doñana - CSIC |
25 | Vega Ruiz Miguel Ángel | GBIF España |
26 | Gálvez Núñez Ángel | Instituto Cavanilles de Biodiversidad y Biología Evolutiva, Universidad de Valencia |
27 | Lujano Bermúdez Carmen | GBIF España |
28 | Mesquita Joanes Francesc | Universitat de València - ICBiBE |
29 | Butrón Mota Ainhize | Sociedad Pública de Gestión Ambiental del Gobierno Vasco (IHOBE) |
30 | Rincón Rincón Beatriz | Universidad de Alcalá de Henares, Grupo de Biodiversidad Marina |
31 | Mora Mayoral Berta | Universitat de Barcelona |
32 | Vila Bonfill Albert | Parque Natural de les Capçaleres del Ter i del Freser |
33 | Quirce Vázquez Cinta | CIBIO - Universidad de Alicante |
34 | Aparicio Sánchez José Ignacio | Doctorando |
35 | Cezón García Katia | GBIF España |
36 | Alonso Felpete José Ignacio | Universidad de Oviedo |