Gbif.es » Formación y divulgación » IV Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad
Workshop
Type

Presencial

Workshop start date

27/10/2010

Workshop end date

29/10/2010

Place

Aula de Seminarios del Real Jardín Botánico (CSIC)

Address

Edificio de Investigación. C/ Claudio Moyano 1.

Trainers

Arturo H. Ariño (Universidad de Navarra-UNED), David Galicia (Universidad Navarra) y Silvia Lusa (GBIF.ES)

Language

English

Maximum number of participants

24

Contact

info@gbif.es

IV Taller sobre imágenes digitales para estudios de biodiversidad

Descripción:

Este taller tratará el proceso de captura, manejo y publicación en internet de imágenes digitales de especímenes de colección y de otras imágenes relacionadas con proyectos de investigación en biodiversidad: láminas, preparaciones microscópicas, etc.

Los temas a tratar irán desde el equipamiento necesario y su configuración (óptica, iluminación, etc.), las técnicas de captura, el procesado de las imágenes y los (meta)datos a recoger para su publicación.

Los alumnos podrán aportar sus propias imágenes, que se procesarán y se publicarán en un servidor instalado al efecto.

Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.
  • Orden de inscripción.

Con la colaboración de la Universidad de Navarra.

Programa

PARTE I: TÉCNICAS AVANZADAS DE IMAGEN DIGITAL.
Arturo H. Ariño y David Galicia.

Miércoles 27

9:30-9:45 – Bienvenida e introducción al curso

9:45-11:00 – Sesión introductoria: Teoría de la imagen digital

  • Nociones básicas sobre imagen
    • Naturaleza de la luz
    • Óptica y formación de la imagen
    • Teoría del Color
  • Captura de una imagen
    • Señal analógica y digital
    • Sensores digitales y respuesta electrónica
    • Requisitos de captura
  • Sistemas de imagen digital
    • Componentes ópticos y electrónicos
    • Equipos de tratamiento de imagen
    • Software de análisis

11:00-11:30 – Pausa para café

11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Adquisición de imagen.

  • Fotografiado de especímenes bidimensionales
    • Ejemplares zoológicos bidimensionales
    • Plantas de herbario
    • Láminas, papel, documentos
  • Fotografiado de especímenes tridimensionales
    • Sistemas y modos de iluminación
    • Planos y ángulos de imagen
    • Ejemplares de tamaño medio y grande
    • Ejemplares para macrofotografía con SLR
    • Motorización
  • Fotomicroscopía
    • Ejemplares para macrofotografía con estereomicroscopio
    • Microfotografía y técnicas de contraste
  • Casos especiales
    • Cajas de colección
    • Material en líquido
    • Imagen morfométrica
    • Imagen infrarroja
    • Especímenes transparentes y brillantes
    • Imagen para clasificación automática

13:30-15:00 Pausa para comer

15:00-16:45 – Sesión teórico-práctica: Prevención de problemas en la imagen

  • Problemas fotográficos
    • Resolución
    • Color
    • Geometría
    • Artefactos

16:45-17:15 – Pausa para café

17:15-18:00

  • Problemas informáticos
    • Pérdida de información
    • Conservación, archivo y durabilidad
    • Costes
    • Compatibilidad de formato
    • Análisis automático de imagen

Jueves 28

09:30-11:00 – Fotografiado de ejemplares de los alumnos

En esta sesión, por turnos y por grupos de casos, los alumnos fotografiarán sus ejemplares de acuerdo a los criterios estudiados el día anterior. Los alumnos que no estén en el laboratorio  tomando las fotos analizarán y criticarán las imágenes del otro grupo, así como las de muestra propuestas por los profesores o las que hayan traído consigo. En la sesión siguiente se abordará el postprocesado, corrección digital y realce.

11:00-11:30 – Pausa para café

11:30-13:30 – Sesión teórico-práctica: Postprocesado y análisis de imagen. Corrección.

  • Procesos generales de la imagen
    • Reencuadre y recorte de imagen
    • Redimensionamiento
    • Ajuste de gama dinámica
    • Corrección cromática
    • Corrección geométrica
    • Limpieza digital
    • Ajuste de la nitidez
  • Retoque fotográfico
    • Tratamientos parciales en la imagen
    • Segmentación
    • Filtros
  • Combinaciones de imágenes
    • Álgebra de imagen
    • Montaje fotográfico
    • Stacks, Automontaje y Extensión de foco
    • Extensión de gama dinámica

13:30h–15:00 – Pausa para comer

15:00-18:00 Sesión flexible con tiempo para continuar el fotografiado de ejemplares problema y tratamiento de formatos de imagen y metadatos.

  • Formatos de imagen
    • Formatos digitales sin pérdida
      • RAW
      • BMP
      • TIFF
    • Formatos de compresión con pérdida única
      • GIF
      • CCIT
    • Formatos de compresión con pérdida acumulativa y flexibles
      • JPG
      • JP2000
  • Metadatos
    • EXIF
    • Bases de datos de imagen
    • Historial de proceso
    • Documentación
    • IPR
    • Trazabilidad

PARTE II: EL PROCESO DE PUBLICACIÓN DE IMÁGENES DIGITALES DE BIODIVERSIDAD EN INTERNET. Silvia Lusa

Viernes 29

9.30 – 11:00

  • Proyectos y bibliotecas digitales en Internet (Flora brasiliensis, Herbario de Berlín, Morphobank, etc).
  • Servidores de imágenes (eRez, IIPImage) vs Repositorio de imágenes.
  • Visualizadores (zoomyfer, FSI Viewer).
  • Servicio de alojamiento y publicación de imágenes de GBIF.ES.
  • Integración del Servicio de alojamiento y publicación de imágenes en la infraestructura de GBIF.ES y de GBIF (protocolos, estándares, portales).

11:00- 11:30 Pausa para café

11:30-13:30

  • Protocolo de uso del Servicio de alojamiento y publicación de imágenes e integración en la red de GBIF. Ejemplo de uso: "Proyecto de digitalización de los dibujos de la Real Expedición Botánica del Nuevo Reino de Granada (1783-1816), dirigida por José Celestino Mutis"
  • Parte práctica: publicación en Internet de imágenes aportadas por los alumnos.
    • Caso práctico I: Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos con el visualizador zoomyfer y publicación en nuestra web.
    • Caso práctico II: Integración de imágenes digitalizadas por los alumnos en el Servicio de Alojamiento de imágenes de GBIF.ES y publicación en nuestra web.

List of participants

Name Organization
1 Gutiérrez Eisman Silvia Instituto Pirenaico de ecología (CSIC)
2 Rodríguez Prieto Iñaki Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC, Madrid)
3 Esparza Alaminos Óscar WWF España
4 Aguado López Mayra Universidad Politécnica de Cartagena
5 Carvalho José Augusto Instituc Botánic de Barcelona
6 Espelleta Rodríguez Miriam Museo Nacional de Ciencias Naturales (CSIC, Madrid)
7 Cuartero Arteta María Teresa MNCN-CSIC
8 Recio Rincón Carlos Junta de Comunidades de Castilla – La Mancha
9 Verdún Castelló Marta Universidad Autónoma de Barcelona
10 Pallàs Serra Jordi Instituc Botánic de Barcelona