Taller sobre provisión de datos colombianos al GBIF en el marco del SIB Colombia
Descripción:
El propósito de este taller es divulgar entre los participantes los principales avances en el área de la gestión de información biológica en los ámbitos nacional e internacional; involucrarlos en la activa provisión de datos y metadatos a la red nacional SiB Colombia y a GBIF, e incrementar en ellos y en sus instituciones la capacidad para el uso de las herramientas técnicas, tecnológicas y procedimientales generadas por el SiB y sus socios internacionales, que les permitan ampliar el potencial de uso de sus datos y compartir su información al país y al mundo apropiadamente.
Este taller está enmarcado dentro del Proyecto conjunto de colaboración con los Nodos de Holanda, Colombia y España.
Fecha: 27-29 Mayo 2008Programa
DÍA 1- 27 de mayo Publicación de datos en la red de GBIF (o en línea)
08:30 Presentación del Taller. Objetivos, agenda de trabajo y resultados esperados, equipo de docentes.
Ximena Franco Villegas, Investigadora Principal SiB.
08:50 Presentación. Introducción a GBIF. (Archivo .ppt; 3.63 Mb).
Francisco Pando, Responsable Unidad de Coordinación GBIF.Es
09:00 Presentación. Estándares y protocolos para especímenes en el ámbito de SiB Colombia y GBIF.
Repaso de conceptos clave (Archivo .ppt; 1Mb)
Angela M. Suárez Mayorga, Administradora líder de contenidos SiB.
10:00 Taller: De la base de datos de trabajo, a la de publicación: mapeo de campos y otras transformaciones
Francisco Pando, Responsable Unidad de Coordinación GBIF.Es
Name parser (https://2022.gbif.es/datos-biodiversidad/participa-en-gbif-es/herramientas-de-publicacion/)
Se trata de una aplicación con base de datos MS Access 2000® para desglosar nombres científicos en sus componentes básicos: género, especie, autor y año: name_parser.zip (archivo .ZIP, 51 Kb). Autor: F. Pando. Se ha adaptado esta misma aplicación para aquellos nombres que vengan compuestos de género, especie, Autor_especie, Rango infraespecífico, Infraespecífico, Autor_infraespecífico y año: name_parser_New.zip (archivo .ZIP, 83 Kb). Adaptación: I. Ortega.
Name Parser (Archivo .mdb; 416 Kb).
Ejemplos Name Parser (Archivo .mdb; 36 Mb)UuBio's PaseIt (http://www.ubio.org/tools/explodeMan.php)
Esta función acepta la entrada de la combinación de un nombre científico, autor y año y la separa en sus componentes como texto plano.Publicación de datos en la red de GBIF o en linea. Francisco Pando (Archivo .ppt; 807 Kb).
10:45 Refrigerio
11:00 Continuación Taller.
Validación
Darwin test (www.gbif.es)
Una aplicación para la validación y chequeo de los datos en formato Darwincorev2, para asegurar una calidad en las bases de datos que se ven a través de la red de GBIFEsquema original de Darwin Core 2 - Inglés (Archivo .pdf; 529 Kb). Esquema no oficial de Darwin Core 2 - Español (Archivo .pdf; 522 Kb).
Tabla de Darwin Core v.1.4 (Archivo .mdb; 3.49 Mb).
Mapeo Darwin Core v. 14 (Archivo .mdb; 3,6 Mb) . Para transformar tablas de la versión actual de Darwin Core (1.2) a la versión que se va a empezar a implementar (1.4)
Mapeo de campos (Archivo .doc; 361 Kb).
11:45 Presentación. Georreferenciación de ocurrencias. Introducción a mejores prácticas. (Archivo .ppt; 7.2 Mb)
Oscar Orrego, Administrador de contenidos-Productos y Servicios SiB.
Basado en talleres de GBIF, como por ejemplo: https://2022.gbif.es/talleres/replica-del-ii-taller-sobre-georreferenciacion-de-gbif/
GBIF's Guide to Best Practices for Georeferencing
12:45 Almuerzo
14:15 Taller: Provisión de datos a GBIF. (Archivo .ppt; 831 Kb).
Silvia Lusa – Responsable de la Infraestructura ITC de GBIF España.
15:45 Refrigerio.
16:00 Taller: Metadatos
Mónica Vera A. Administradora del Catálogo nacional de metadatos de conjuntos de datos relacionados con biodiversidad.
Francisco Pando, Responsable Unidad de Coordinación GBIF.es
DÍA 2- 28 de mayo Administración de información de especies.
08:30 Presentación. Plinian Core - Introducción, historia, requerimientos, objetivos.
Francisco Pando.
Plinian Core. Un perfil de datos para publicar y compartir información de especies biológicas. Francisco Pando (Archivo .ppt; 1.3 Mb).
Plinian Core. Conceptos (Archivo .pdf; 103 Kb).
09:15 Presentación. Plinian Core: su forma actual.
Francisco Pando.
Plinian Core. Atributos Flora Ibérica (Archivo .pdf; 93 Kb)
Poster Plinian Core v2 (Archivo .pdf; 780 Kb).
09:45 Presentación. De desarrollo teórico a la realidad.
Francisco Pando.
1. El portal de IABIN Video portal de especies (IABIN). Francisco Pando.
2. El portal de gbif.es Video portal de gbif.es. Francisco Pando (Archivo .swf; 1.9 Mb).
10:30 Valoración
Francisco Pando
11:00 Refrigerio
11:15 Conversatorio/ Sesión de discusión.
Ángela M. Suárez Mayorga, Francisco Pando. Todos los participantes
12:30 Almuerzo.
14:00 Presentación. Hacia una(s) herramienta(s) de captura.
Francisco Pando
Herramientas de captura (Archivo .zip; 989 Kb)
Notación etiquetas Wiki para especies.
14:30 Presentación. El catálogo de especies colombianas SiB. Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 2 Mb)
15:30 Refrigerio
15:45 Taller. Documentación de fichas de especies. Oscar Orrego, Mónica Vera. (Archivo .ppt; 700Kb).
17:15 Sesión de cierre.
DÍA 3- 29 de mayo
08:30 Presentación. Esquema SiB de gestión de información sobre biodiversidad. Ximena Franco Villegas. (Archivo .ppt; 7.4 Mb)
09:15 Presentación. Introducción a los productos y servicios de información. Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 305 Kb)
09:30 Presentación. Sistema distribuido de búsquedas. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 1.7 Mb)
10:00 Presentación. El papel de los metadatos en la gestión de información de especímenes. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 2.3 Mb).
10:30 Refrigerio.
10:45 Presentación. Ruta gestión de información de especímenes. Paola Andrea Cubillos. Administradora de contenidos SiB. (Archivo .ppt; 2.5 Mb).
11:15 Presentación. Metadatos en el SiB Colombia. Ángela M. Suárez Mayoraga. (Archivo .ppt; 5.4 Mb).
12:00 Almuerzo.
14:00 Presentación. Servicios de búsqueda y divulgación de información. María Andrea Oriuela. Administradora de contenidos SiB. (Archivo .ppt; 432 Kb).
14:30 Presentación. Indicadores de conocimiento sobre biodiversidad. Oscar Orrego. (Archivo .ppt; 23 Mb).
15:00 Presentación. Sesión de trabajo para aclaración de dudas y aplicación de herramientas a datos propios. Todos los participantes.
16:00 Refrigerio.
16:15 Continuación Taller.
16:45 Sesión de cierre.