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Gbif.es » Formación y divulgación » V Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)
Workshop
Type

En línea

Workshop start date

20/10/2022

Workshop end date

04/11/2022

Place

modalidad online

Trainers

Alejandro González (RJB-CSIC) y Julia Chacón (INIA)

Language

English

Maximum number of participants

30

Estimated duration

30

Contact

info@gbif.es

Hashtag

tallerRonline2022

V Taller GBIF.ES online: Manejo, visualización y análisis de datos en ecología con R (nivel iniciación)

Descripción

Este curso pretende sentar las bases para usar y desarrollar R de una manera autónoma y utilizar el software para manejar, manipular, visualizar y analizar datos de ecología y biodiversidad. Se hace especial énfasis en aquellas herramientas que posibilitan ser un usuario eficiente del programa.

El taller es parte del programa de cursos de especialización del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, que extenderá un certificado de aprovechamiento del mismo para aquellos/as alumnos/as que superen los objetivos marcados.

Metodología

El presente curso se desarrollará en la Plataforma de Formación Virtual de GBIF.ES (http://elearning.gbif.es/). Combinaremos la impartición de vídeo tutoriales donde, en vídeos muy cortos, explicaremos paso a paso, desde las primeras operaciones con el programa como la gestión de archivos, a los rudimentos del análisis estadístico, la programación para trabajar de manera eficiente o los estilos más modernos de trabajo en el entorno R.

Pasos a seguir para matricularse:
  • Rellenar formulario de inscripción hasta el 26 de septiembre de 2022.
  • La Unidad de Coordinación de GBIF España contactará con los/as alumnos/as admitidos/as para solicitar confirmación de asistencia al taller hasta el 6 de octubre de 2022*.
  • Publicación de lista de alumnos en la página web del taller el 10 de octubre de 2022.
*Si no se ha recibido confirmación en dicha fecha, la reserva se anulará automáticamente.

Proceso de selección: Las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección. Se procurará que en el taller puedan participar el mayor número de instituciones y países interesados, por lo que a la hora de hacer la selección se tendrán en cuenta los siguientes aspectos:

  • Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
  • Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
  • Conocimientos sobre la materia.
  • Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF España.

Requisitos técnicos del taller: Disponer de un ordenador con al menos 4 GB de memoria RAM.

Conocimientos previos: Este curso está concebido para personas sin conocimientos previos de R o con muchas lagunas. Sin embargo, puede aportar conocimientos a personas interesadas en aprender programación o escritura eficiente de código.
Programa

Módulo 0: PRESENTACIÓN DEL CURSO

  • Presentación del profesorado.
  • GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.

Módulo 1: INTRODUCCIÓN

  • Qué es R.
  • Instalación de R.
  • Instalación de R Studio.
  • Partes de R: consola y primeros comandos.
  • Funciones y objetos en R.
  • Partes de R Studio.
  • Optimización de R Studio.
  • Bajada de paquetes.
  • Otras herramientas GUI.

Módulo 2: MANEJO DE DIRECTORIOS

  • Uso de carpetas y ubicaciones.
  • Creación de ficheros y objetos.
  • Empezar con el caso de estudio.

Módulo 3: TIPOS DE OBJETOS

  • Introducción a los tipos de datos y estructuras.
  • Vectores y operaciones con vectores.
  • Matrices.
  • Marcos de datos.
  • Listas y arrays.
  • Operaciones con texto.
  • Otros tipos.

Módulo 4: MANIPULACIÓN DE OBJETOS

  • Operaciones básicas para conocer los objetos.
  • Operaciones de un tipo de dato a otro.
  • Transformación en marcos de datos.
  • Innovaciones en R (tidyverse).
  • Optimización del código mediante el tidyverse.

Módulo 5: GRÁFICOS BÁSICOS

  • Gráficos del paquete básico.
  • Otras operaciones.
  • Ejercicio guiado.

Módulo 6: GGPLOT

  • Filosofía de ggplot.
  • Operaciones básicas de ggplot.
  • Boxplots.
  • Histogramas y densidad.
  • Scatterplots.
  • Barras, etc.
  • Trucos.
  • Leyendas, etiquetas, posiciones.
  • Ejercicio guiado.

Módulo 7: PROGRAMACIÓN EFICIENTE

  • Introducción a la programación y justificación.
  • Bucles for.
  • Bucles while.
  • Condicionales if else.
  • Resolviendo problemas de las simulaciones.
  • Creación de funciones I.
  • Creación de funciones II.
  • Funciones de la familia apply.

Módulo 8: RECURSOS EXTERNOS

  • Ayuda de R.
  • Stack overflow.
  • GitHub.

Módulo 9: PUBLICACIÓN CON R

  • Introducción a R markdown.
  • Generación de trozos de código.
  • Operar con imágenes.
  • Operar con tablas.
  • Operar con índices.
  • Otros tipos.

Módulo 10: INTRODUCCIÓN A LA ESTADÍSTICA

  • Visión general de la estadísitca en R.
  • Primeros pasos de la estadística básica en R.
  • Distribuciones.
  • Obtención de algunos parámetros de los modelos.
  • Estadística no paramétrica.
  • Introducción a modelos más complejos.
  • Ejercicio guiado.

tallerRonline2022

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List of participants

Nº Name Organization
1 Jiménez López María Esther Universidad Autónoma de Baja California Sur
2 Pérez Briceño Paula Marcela Universidad de Costa Rica
3 Sanz Zubizarreta Iratu Universidad del País Vasco (UPV-EHU)
4 Hernández Mateo Laura ICIFOR- INIA,CSIC
5 Sanz Enguita Daniel Centro de Colecciones Científicas de la Universidad de Almería
6 Adame Hernando Patricia ICIFOR, INIA-CSIC
7 Sánchez Carmona Sara Universidad del País Vasco
8 Colangelo Michele CSIC, Instituto Pirenaico de Ecologia (IPE-CSIC)
9 Arbiza Jiménez Andrés TRAGSATEC
10 Hermosilla Lorenzo Brais Jardín Botánico de Olarizu (JBO)
11 Pérez Allende Roberto UIB - Universidad de las Islas Baleares
12 Pizarro Gavilán Manuel Instituto Pirenaico de Ecología
13 Rodriguez Natalia Museo Argentino de Ciencias Naturales Bernardino Rivadavia CONICET
14 Muriel Abad Roberto Estación Biológica de Doñana (EBD-CSIC)
15 Mondragón Fonseca Silvia Patricia Corporación Autónoma regional de Chivor, CORPOCHIVOR
16 Salcedo Rivera Gerson A. Universidad de Sucre
17 Muñoz Garachana Diego Junta de Castilla y León
18 Tapia Román Nuria AMAYA
19 Salmerón Jiménez Francisca CN Instituto Español de Oceanografia-CSIC
20 Ferrer Sánchez Yarelys UNIVERSIDAD TÉCNICA ESTATAL DE QUEVEDO
21 Burguera i Martín Carles Jardín Botánico Marimurtra/Universidad de Barcelona
22 Regnet Miguel Antonio Universidad Nacional del Nordeste
23 Muñoz de los Reyes Isabel Centro Oceanográfico de Cádiz (IEO-CSIC)
24 Martín García Laura CSIC-Instituto Español de Oceanografía (IEO)
25 Román Moreno Sara Instituto Español de Oceanografía, C.O Cádiz
26 Villegas Navarro Silvia Real Jardín Botánico, CSIC
27 Romo Benito Helena Universidad Autónoma de Madrid
28 García San León David Universidade de Santiago de Compostela
29 Dueñas Carazo Margarita Real Jardín Botánico, CSIC
30 Montagud Alario Sergio Universitat de València