VI Taller GBIF de Modelización de Nichos Ecológicos
Descripción:
La Unidad de Coordinación de GBIF en España organiza el quinto taller de modelización de nichos ecológicos. En este taller práctico se estudiarán los conceptos básicos para poder realizar análisis de datos biológicos a través de la modelización, así como el manejo de herramientas como Desktop GARP o MaxEnt.
Debido al número limitado de plazas disponibles, las solicitudes presentadas se someterán a un proceso de selección donde se evaluarán los siguientes aspectos:
- Adscripción a una institución que colabore y/o provea datos a través de la red de GBIF.
- Número de solicitudes presentadas desde esa misma institución.
- Conocimientos sobre la materia.
- Solicitud y/o presencia en talleres anteriores de GBIF de la misma temática.
- Orden de inscripción.
Programa
Martes 4 de Mayo
09:30 - 09:50 Introducción al taller: organización y planificación. Marco del taller: GBIF y la información primaria sobre biodiversidad.
09:50 - 10:15 Introducción a la Bioinformática
10:15 - 11:15 Conceptos para la correcta utilización de los datos cartográficos. (Alicia Gómez)
o Conceptos básicos sobre cartografía.
o Conceptos básicos sobre geodesia.
o Teledetección.
11:15 - 11:45 Pausa para café
11:45 - 13:00 Bases conceptuales para la modelización del nicho ecológico.
o Nicho fundamental versus nicho realizado.
o La modelización matemática del nicho realizado.
o Del espacio ecológico al espacio geográfico.
o El proceso de modelización: esquema conceptual.
13:00 - 13:30 Los modelos de nicho ecológico.
o Etapas en la construcción de un modelo de nicho ecológico.
o Limitaciones de los modelos de nicho.
13:30 - 15:00 Pausa para comida
15:00 - 16:00 Disponibilidad, tipo y acceso a los datos
o Los datos biológicos.
o Los datos ambientales.
o Salidas de los modelos.
16:00 - 18:00 Prácticas: descargar datos de GBIF, repaso del uso de los SIG (con pausa de media hora para café)
Miércoles 5 de Mayo
9:30 - 10:00 Limitaciones metodológicas:
o Las cuestiones de escala.
o ¿Cómo elegir las variables ambientales a incluir en el modelo?
10:00 - 11:00 Evaluación y validación del modelo
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 12:30 ¿Qué modelo (software) elegir?
o BIOCLIM
o DOMAIN
o GARP
o MAXENT
12:30 - 13:30 Interfaz BIOCLIM e Interfaz DOMAIN
13:30 - 15:00 Pausa para comida
15:00 - 16:30 Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en GARP
16:30 - 18:00 Modelización con BIOCLIM y DOMAIN (con pausa de media hora para café)
Jueves 6 de Mayo
9:30 - 11:00 Prácticas con GARP
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 13:30 Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en MAXENT.
13:30 - 15:00 Pausa para comida
15:00 - 16:30 Prácticas con MAXENT
16:30 - 17:00 Pausa para café
17:00 - 18:00 Interpretación de resultados GARP vs. MAXENT (basado en ejemplos)
Viernes 7 de Mayo
9:30 - 10:00 Aplicaciones de los modelos de nicho a estudios de Cambio Global y Biología de la Conservación.
10:00 - 10:45 Prácticas y resolución de dudas
10:45 - 11:00 Evaluación del taller
11:00 - 11:30 Pausa para café
11:30 - 13:30 Debate, dudas y sugerencias
Attached Documents
Información sobre los formatos necesarios para trabajar Formulario de inscripción GBIF y la información primaria sobre biodiversidad. Cristina Villaverde (archivo .pdf; 1.6 Mb) Conceptos para la correcta utilización de los datos cartográficos. Alicia Gómez (Fichero .PDF; 1.6 Mb) Introducción al taller. Elisa Liras (Fichero .PDF; 402Kb) Introducción a la Bioinformática. Elisa Liras (Fichero .PDF; 2.29 Mb) Bases conceptuales para la modelización de nicho ecológico. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.95 Mb) Los modelos de nicho ecológico. Elisa Liras (Fichero .PDF; 800Kb) Disponibilidad, tipo y acceso a los datos. Elisa Liras (Fichero .PDF; 3.41Mb) Prácticas I. Descargar datos de GBIF, repaso del uso de los SIG. Elisa Liras (Fichero .PDF; 4.51Mb) Limitaciones metodológicas. Elisa Liras (Fichero .PDF; 803 Kb) Evaluación y validación del modelo. Elisa Liras (Fichero .PDF; 486 Kb) Qué modelo elegir. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.06 Mb) Interfaz BIOCLIM e Interfaz DOMAIN. Elisa Liras (Fichero .PDF; 2.33 Mb) Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en GARP. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.06 Mb) Modelización con BIOCLIM y DOMAIN. Elisa Liras (Fichero .PDF; 152Kb) Prácticas II con GARP. Elisa Liras (Fichero .PDF; 230 Kb) Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en MAXENT. Elisa Liras (Fichero .PDF; 1.86 Mb) Interpretación de resultados GARP vs. MAXENT. Elisa Liras (Fichero .PDF; 199 Kb) Aplicaciones de los modelos de nicho a estudios de Cambio Global y Biología de la Conservación. Elisa Liras (Fichero .PDF; 3.65 Mb) Ejemplo. Elisa Liras (Fichero .PDF; 400 Kb) GARP para torpes. Javier Seoane (Fichero .PPT; 697 Kb) Conceptos para la correcta utilización de los datos cartográficos. Alicia Gómez (vídeo) Bases Conceptuales para la modelización de nicho ecológico. Elisa Liras (vídeo) Los Modelos de Nicho Ecológico (vídeo) Limitaciones metodológicas. Elisa Liras (vídeo) Evaluación y validación del modelo. Elisa Liras (vídeo) Qué modelo elegir. Elisa Liras (vídeo) Interfaz DOMAIN e Interfaz BIOCLIM. Elisa Liras (vídeo) Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en MAXENT . Elisa Liras (vídeo) Funcionamiento, interfaz y formato de los datos (entrada y salida del modelo) en GARP. Parte 1. Elisa Liras (vídeo) Aplicaciones: Cambio Global & Biología de la Conservación.. Elisa Liras (vídeo)Documents of Interest
Assessing changes in habitat quality due to land use changes in the spur-thighed tortoise Testudo graeca using hierarchical predictive habitat models. (Archivo .pdf; 228 Kb) Effects of Land-Cover Transformation and Climate Change on the Distribution of Two Microendemic Lizards, Genus Uma of Northern Mexico . (Archivo .pdf; 700 Kb) Conservation of the rare British lichen Vulpicida pinastri. (Archivo .pdf; 7 Mb) Modelling climate change impacts on species’ distributions at the European scale: implications for conservation policy. (Archivo .pdf; 300 Kb) The ability of climate envelope models to predict the effect of climate change on species distribution. (Archivo .pdf; 224 Kb) Modelling ecological niches from low numbers of ocurrences... (Archivo .pdf; 788 Kb) Predicting the impacts of climate change on the distribution of species: are bioclimate envelope models useful? (Archivo .pdf; 300 Kb) Highly Pathogenic H5N1 Avian Influenza: Entry Pathways into North America via Bird Migration. (Archivo .pdf; 359 Kb) PREDICTING THE GEOGRAPHY OF SPECIES’ INVASIONS VIA ECOLOGICAL NICHE MODELING (Archivo .pdf; 744 Kb) Predicting Species Invasions Using Ecological Niche Modeling: New Approaches from Bioinformatics Attack a Pressing Problem (Archivo .pdf; 659 Kb) Future projections for Mexican faunas under global climate change scenarios (Archivo .pdf; 345 Kb) Tracking population extirpations via melding ecological niche modeling with land-cover information. (Archivo .pdf; 485 Kb) Bottom-up and climatic forcing on the worldwide population of leatherback turtles. (Archivo .pdf; 1.7 Mb) Prioritisation of Mexican lowland rain forests for conservation using modelled geographic distributions of birds. (Archivo .pdf;456 Kb) Modelling the potential geographic distribution of invasive ant species in New Zealand. (Archivo .pdf; 296 Kb) Neural Network FAQ (Archivo .pdf; 2 Mb) DIRECTIVA 2007/2/CE INSPIRE (Archivo .pdf; 109 Kb) Necesidad de un nuevo "Datum" (Archivo .pdf; 221 Kb) Sistema de referencia Geodésico (Archivo .pdf; 120 Kb) Datos climáticos (Archivo .rar; 120 Mb) Manual DIVA-GIS 5.2 en inglés. (Archivo .pdf; 585 Kb) Manual DIVA-GIS 4 en español. (Archivo .pdf; 1.25 Mb) Manual GARP. (Archivo .doc; 455 Kb) GARP: preguntas frecuentes (archivo .doc; 36 Kb) Tutorial Maxent en inglés. (Archivo .doc; 905 Kb) Tutorial Maxent en español. (Archivo .doc; 1.6 Mb)
List of participants
| Nº | Name | Organization |
|---|---|---|
| 1 | Recio Rincón Carlos | Junta de Comunidades de Castilla – La Mancha |
| 2 | Cabana Otero Martiño | Universidade de A Coruña |
| 3 | García-Amorena Gómez del Moral Ignacio | Univerdidad Politécnica de Madrid |
| 4 | García-Cervigón Morales Ana Isabel | Universidad Complutense de Madrid |
| 5 | Prado Castillo Luis Fernando | Universidad de Alcalá |
| 6 | Sangüesa Barreda Gabriel | Instituto Pirenaico de Ecología (CSIC) |
| 7 | Rodríguez García Erik | Socio de Sociedad Entomológica Aragonesa |
| 8 | Longares Aladrén Luis Alberto | Universidad de Zaragoza |
| 9 | Martínez Moreno Isabel | Universidad Rey Juan Carlos |
| 10 | Pastor Llorca Estrella | IMEM-Universidad de Alicante. Instituto Multidisciplinar para el Estudio del Medio "Ramón Margalef" |
| 11 | Mellado Díaz Andrés | Universidad de Murcia |
| 12 | Acero Jiménez Ariadna | Instituto Español de Oceanografía |
| 13 | de Jesús Bernal Pérez María Catalina | Universidad Complutense de Madrid |
| 14 | Fernández Calzado Mª Rosa | Universidad de Granada |
| 15 | Bidegaray Batista Leticia | Universidad de Barcelona |
| 16 | Oreja Gutiérrez Leire | Sociedad de Ciencias Aranzadi |
| 17 | Fernández Fernández Juan Gabriel | Real Jardín Botánico-CSIC |
| 18 | Castillejo Moreno José Miguel | Centro de Ciencias Medioambientales |
| 19 | Del Val Andrés Víctor | Observatorio de la Sostenibilidad en España (OSE) |
| 20 | Marcos Prado María Teresa | INIA |
| 21 | Tamayo Uria Ibon | Centro de Biodiversidad de Euskadi |
| 22 | Dueñas Carazo Margarita | Real Jardín Botánico-CSIC |
| 23 | Iriondo Alegría José María | Universidad Rey Juan Carlos |
| 24 | Rubiales-Jiménez Juan Manuel | E.T.S. Ingenieros de Montes |